İç Anadolu bölgesinde olması nedeniyle karasal iklim kuşağı içindedir. Ancak, Altınekin’deki karasal iklimin özellikleri İç Anadolu’nun karasal iklim tipinden çok, Doğu Anadolu’nun karasal iklim tipi ile benzerlik göstermektedir. Altınekin ile Konya arasında iklim farklılıkları vardır. Yaz ayları çok sıcak, kış ayları ise sert ve soğuk geçmektedir. Ortalama yıllık sıcaklık 10.9 c’dir. Kış aylarının büyük bir kısmında don olayı görülür. İlçede yıllık değerlere göre yağış miktarı ise, 373,5 mm.dir.

    Altınekin merkezinde baktığımız zaman yıllık ortalama donlu gün sayısı 88'dir. Yılın Ocak, Şubat, Mart, Kasım ve Aralık aylarını incelediğimiz zaman donlu gün olaylarının genelde bu aylarda yoğunlaştığı gözlenmektedir

    En fazla donlu gün sayısının olduğu mevsim kış mevsimidir. Kış mevsiminin 66 günü olan don olayları yıllık donlu gün sayısının %75'ini oluşturmaktadır. İlkbahar mevsiminde ise sadece mart ayında 14 gün don olayları yaşanmaktadır ve yıllık donlu gün sayısının %15,9'unu oluşturmaktadır. Sonbahar mevsiminde ise sadece kasım ayında 8 günlük bir don olayı yaşanır ve zaten kışın geldiğinin habercisidir bu donlu günler ve yıllık donlu gün sayısının %9,1'ini oluşturmaktadır.